Balstogės universitetas buvo įkurtas 1997 m., pertvarkius 29 metus veikusį Varšuvos universiteto filialą. Dėl savo lygio ir akademinio potencialo šiandien UwB yra vienas didžiausių ir dinamiškiausių akademinių padalinių šiaurės rytų Lenkijoje.
Universitete veikia dešimt fakultetų, įskaitant išeivijos fakultetą Siedlcuose ir užsienio fakultetą Vilniuje. Dėsto ir paskaitas skaito apie 900 akademinių dėstytojų (daugiau kaip 200 yra nepriklausomi mokslininkai). Šiuo metu universitete mokosi daugiau kaip 18 000 studentų 28 fakultetuose pagal dieninę ir neakivaizdinę sistemą. Jis taip pat siūlo platų antrosios pakopos studijų spektrą - 90 rūšių.
Doktorantūros studijos vykdomos penkiuose UwB padaliniuose: Teisės fakultete, Ekonomikos ir vadybos fakultete, Filologijos fakultete, Istorijos ir sociologijos fakultete bei Biologijos ir chemijos fakultete. UwB turi 10 teisių teikti daktaro laipsnius ir 4 teises teikti podoktorantūros laipsnius. Universitete veikia daugiau kaip 70 mokslinių draugijų ir studentų organizacijų.
UwB moksliniai pasiekimai - dalyvavimas 5-ojoje, 6-ojoje ir 7-ojoje bendrojoje programose ir DAPHNE III programoje. Dalyvaudamas šiose programose, jis vykdė mokslinių tyrimų projektus fizikos, chemijos, pedagogikos, informatikos ir matematikos, ekonomikos ir filologijos srityse.
Šeštojoje bendrojoje programoje UwB fizikai vadovavo projektui „Combined Study of Nanostructured Magnetic Materials“ (NANOMAG-LAB), o šiuo metu dalyvauja Septintojoje bendrojoje programoje projekte „Femtosekundinis optinis magnetizmas ir nauji požiūriai į ultraspartųjį magnetizmą nanomastelyje“ (FANTOMAS). Pedagogikos ir psichologijos fakultetas savo ruožtu įgyvendino projektą „Intymaus partnerio smurtas prieš vyresnio amžiaus moteris“ pagal DAPHNE III programą.
Balstogės universitetas šiuo metu įgyvendina 39 bendradarbiavimo mokslinių tyrimų srityje sutartis su užsienio partneriais universitetais. Nuo 1999 m. jis taip pat dalyvauja Europos švietimo programoje Erasmus. Pagal šią programą universitetas bendradarbiauja su 104 universitetais partneriais iš 22 Europos Sąjungos šalių, taip pat Turkijos ir Šveicarijos.
Studijų programos yra pritaikytos prie regiono poreikių ir galimybių. Juose taip pat atsižvelgiama į užsienyje gyvenančių mūsų tautiečių poreikius. Balstogės universiteto studijų programoje numatytos Katalikų ir Stačiatikių Bažnyčios teologijos studijos. Jos turi svarbų ekumeninį aspektą ir pabrėžia universiteto specifiką. mokymo kokybę UwB, be kita ko, patvirtina ir tai, kad Universiteto akreditavimo komisija keturių fakultetų - istorijos, ekonomikos, chemijos ir biologijos - studijoms suteikė aukštos kokybės mokymo kokybės sertifikatą. Savo ruožtu Valstybinė akreditavimo komisija iki šiol akreditavo: administravimo, biologijos, chemijos, aplinkos apsaugos, informatikos, pedagogikos, teisės, matematikos, filologijos ir lenkų filologijos, sociologijos, istorijos, fizikos ir ekonomikos. Nuo 2008 m. chemijos fakultetas gali pasigirti Europos akreditacija „Eurobachelor Label“ ir „Euromaster Label“.
Už didelį indėlį mokslo ir visuomeninio-politinio gyvenimo srityse universitetas garbės daktaro vardą suteikė dešimčiai iškilių asmenybių: Jerzy Wilkin, profesoriui Bruno Holyst, Lenkijos Respublikos prezidentui tremtyje Ryszard Kaczorowski, Paryžiaus „Kultūros“ įkūrėjui Jerzy Gedroyc, profesoriui Andrzej Stelmachowski, profesoriui Andrzej Wyczański, Lenkijos autokefalinės stačiatikių bažnyčios vadovui metropolitui Sava, prof. Marcelis Morabito, Balstogės arkivyskupas metropolitas Prof. Edwardas Ozorowskis, Prof. Keiichi Yamanaka. Tai, be kita ko, liudija šios investicijos: universiteto bibliotekos statyba, Teisės fakulteto auditorijos, sporto salės, skaičiavimo centro ir Matematikos ir informatikos fakulteto mokomojo pastato statyba. Didžiausias projektas universiteto istorijoje - universiteto miestelio Balstogėje, Ciołkowskio gatvėje, statyba.
